4399傲视天地战斗需要选择相应的阵型。游戏中共提供8种阵型供玩家选择,每种阵型的出场武将数以及阵型威力随该阵型等级提升而增加。2级阵型可以容纳3名武将,5级阵型4名,10级阵型5人。每种阵型为部队提供的加成各不相同,需要根据实际情况随机应变。玩家需要设置一个默认阵型之后,才能使用该阵型出战。
大型战斗虽然爽快,但是为了避免新游戏玩家沉迷于战争之中,游戏设置了军令系统。玩家每战斗一次会消耗一个军令,军令每小时回复1个。每次攻击之后都需要一定的军令冷却时间。每天的8点30,12点30,19点三个时间点会为玩家增加“征战”“农田”“银矿”“攻击”“征服”5个专属军令。主城每升一级会获得一个军令。玩家达到一定消费等级之后可以使用金币购买军令,消费等级越高购买上限越多。和建筑疲劳值一样,军令所需冷却时间会随着玩家征战次数增加而延长。每天凌晨5点,疲劳值会归零。